Lo que vos querés hacer se llama Chroma Key o Croma simplemente.
La pantalla de fondo tiene que ser de algún color primario (Rojo, Verde, Azul), pero se utiliza solamente Verde y Azul por que el rojo en la piel se nota mucho...

Para que quede bien el croma tenés que tener una buena pantalla y una buena iluminación, sino no vas a poder sacar totalmente el fondo...

Tengo experiencia en edición de video y te puedo decir que la forma más practica de hacerlo (y más rápida) es con Sony Vegas, Premiere y Final Cut o similares no me gustan..

Saludos y suerte..